Im Rahmen des Aktionsplans in fünf Etappen des Justinus-Werks, führt die Direktorin Natacha Roos die Organisation der Stiftung weiter, damit diese so nah als möglich an den Wünschen und Bedürfnissen der Studenten ist, um den Auftrag zu realisieren. Aktiv und dynamisch unterstützt durch den Stiftungsrat sowie durch Mitarbeitende, die über eine ausgezeichnete Innovationskraft verfügen. Nachdem sie das Studentenheim in Genf neu organisiert hatte,
gliederte sie das Justinus-Werk in drei sich ergänzende Bereiche:
Alle Massnahmen des Justinus-Werks sind auf Partizipation ausgerichtet: Die Mitarbeiter werden voll und ganz in die organisatorischen Veränderungen einbezogen. In Freiburg, dem Sitz der Bereiche „Werk“ und „Administration“, soll eine von Januar bis April 2026 durchgeführte Testphase sicherstellen, dass die umgesetzten Veränderungen den Bedürfnissen bestmöglich entsprechen.Diese neue Organisation stärkt die Grundlagen des Justinus-Werks und ermöglicht es ihm, seine Mission im Dienste der Studierenden mit Effizienz und Weitsicht fortzusetzen .